1937年12月の南京攻略戦を行った日本軍部隊は、中支那方面軍（11月7日編成、方面軍司令官：松井石根大将、参謀長：塚田攻少将、参謀副長：武藤章大佐）です。
中支那方面軍は、上海派遣軍（軍司令官：朝香宮中将、参謀長：飯沼守少将）と第10軍（軍司令官：柳川平助中将、参謀長：田辺盛武少将）を統合指揮するための組織ですが、司令部の実態としては貧弱なものでした。
上海派遣軍は隷下に、第3師団（師団長：藤田進中将）、第9師団（師団長：吉住良輔中将）、第11師団（師団長：山室宗武中将）、第13師団（師団長：荻洲立兵中将）、第16師団（師団長：中島今朝吾中将）、第101師団（師団長：伊東政喜中将）、野戦重砲兵第5旅団（旅団長：内山英太郎少将）を持っていますが、南京城攻略戦に参加したのは、第16師団、第9師団、山田支隊（第13師団の一部：山田栴二少将）、第3師団先遣隊になります。
第10軍は隷下に、第6師団（師団長：谷寿夫中将）、第18師団（師団長：牛島貞雄中将）、第114師団（師団長：末松茂治中将）、国崎支隊（第5師団の一部：国崎登少将）、野戦重砲兵第6旅団（旅団長：石田保道少将）を持っていますが、南京城攻略戦に参加したのは第6師団、第114師団になります。
関連師団
この頃の日本軍はまだ4単位師団が基本です*1。
| 所属歩兵旅団及び連隊 | 備考 | |
|---|---|---|
| 第3師団先遣隊 | 歩68 | |
| 第9師団 | 歩6旅（歩7、歩35）、歩18旅（歩19、歩36） | |
| 山田支隊 | 歩65 | 第13師団の一部 |
| 第16師団 | 歩19旅（歩9、歩20）、歩30旅（歩33、歩38） | |
| 第6師団 | 歩11旅（歩13、歩47）、歩36旅（歩23、歩45） | |
| 第114師団 | 歩127旅（歩66、歩102）、歩128旅（歩115、歩150） |
連隊と虐殺事件の対応（不完全）
| 第3師団歩兵第5旅団歩兵第68連隊 | 3D先遣隊 | ||
| 第9師団歩兵第6旅団歩兵第7連隊 | 「七千余ノ敗残兵ヲ殲滅セリ」*2 | ||
| 第9師団歩兵第6旅団歩兵第35連隊 | |||
| 第9師団歩兵第18旅団歩兵第19連隊 | |||
| 第9師団歩兵第18旅団歩兵第36連隊 | |||
| 第13師団歩兵第103旅団歩兵第65連隊 | 山田支隊 | 幕府山事件「皆殺せとのことなり」 | |
| 第16師団歩兵第19旅団歩兵第9連隊 | |||
| 第16師団歩兵第19旅団歩兵第20連隊 | 馬群における捕虜虐殺事件、「六百人近くの敗残兵の大群を（略）一度に銃殺」*3 | ||
| 第16師団歩兵第30旅団歩兵第33連隊 | 佐々木支隊 | 「俘虜ハ処断ス」、「敗残兵三百名処決セリ」 | |
| 第16師団歩兵第30旅団歩兵第38連隊 | 佐々木支隊 | 「各隊ハ師団ノ指示アル迄俘虜ヲ受付クルヲ許サズ」「白旗ヲ植立スルモノ数千」 | |
| 第6師団歩兵第11旅団歩兵第13連隊 | 「「一千名以上の敗残兵」を、中華門外で集団射殺」*4 | ||
| 第6師団歩兵第11旅団歩兵第47連隊 | 「敗残兵一五名ヲ刺殺」 | ||
| 第6師団歩兵第36旅団歩兵第23連隊 | 「チャンコロ約二千名ゾロゾロ白旗掲げて降参（略）殺して仕舞ったらしい」*5 | ||
| 第6師団歩兵第36旅団歩兵第45連隊 | |||
| 第114師団歩兵第127旅団歩兵第66連隊 | 「旅団命令ニヨリ捕虜ハ全部殺スベシ」*6 | ||
| 第114師団歩兵第127旅団歩兵第102連隊 | |||
| 第114師団歩兵第128旅団歩兵第115連隊 | |||
| 第114師団歩兵第128旅団歩兵第150連隊 |
